相關規定：
財政部69年6月12日台財稅第34657號函規定：
公司僱用之服務技術人員因業務需要，於平時工作時間以外延長工作時間支領之加班費，如未超過規定標準者，可適用所得稅法第14條第1項第3類第2款但書規定免納所得稅，並免予扣繳。
惟如不論有無加班及加班時數多寡，一律按月定額給付者，則屬同條款規定之津貼，應併同薪資所得扣繳稅款，不得適用免稅規定。
所得稅法第14條第1項第3類第4款規定：
第一款薪資收入包括：薪金、俸給、工資、津貼、歲費、獎金、紅利及各種補助費。但為雇主之目的，執行職務而支領之差旅費、日支費及加班費不超過規定標準者，及依第四條規定免稅之項目，不在此限。
勞動基準法第32條第1項及第2項規定：
雇主有使勞工在正常工作時間以外工作之必要者，雇主經工會同意，如事業單位無工會者，經勞資會議同意後，得將工作時間延長之。
前項雇主延長勞工之工作時間連同正常工作時間，一日不得超過十二小時；延長之工作時間，一個月不得超過四十六小時，但雇主經工會同意，如事業單位無工會者，經勞資會議同意後，延長之工作時間，一個月不得超過五十四小時，每三個月不得超過一百三十八小時。
說明：
營利事業給付薪資給員工，屬於所得稅法第88條規定應扣繳的所得，須由該營利事業之負責人(即扣繳義務人)依薪資所得扣繳辦法規定辦理扣繳；又依所得稅法第14條第1項第3類第4款本文規定，薪資收入包括薪金、俸給、工資、津貼、歲費、獎金、紅利及各種補助費，另依財政部69年6月12日台財稅第34657號函規定，員工因業務需要，於平時工作時間以外延長工作時間支領之加班費，如未超過勞動基準法第32條規定之標準者，可適用所得稅法第14條第1項第3類第4款但書規定，免納所得稅，並免予扣繳。
惟如不論有無加班及加班時數多寡，一律按月定額給付者，則屬同條款規定之津貼，應併同薪資所得辦理扣繳，並列入該員工之薪資所得。
扣繳義務人如有上述短扣繳之情事，凡未經檢舉、未經稅捐稽徵機關或財政部指定之調查人員進行調查，自動向稅捐稽徵機關補報並補繳稅款者，可適用稅捐稽徵法第48條之1規定，加計利息免罰。
舉例：
A公司107年度與甲君約定每月薪資100,000元，及按月額外給付加班費25,000元，惟A公司僅以甲君月薪100,000元扣繳稅款。經國稅局查核發現，A公司不論甲君每月加班時數多寡，均併同當月薪資定額給付其加班費25,000元，國稅局遂依前揭法令規定，核認A公司之負責人(即扣繳義務人)未依規定辦理扣繳，除限期責令補繳短扣之稅款及補報扣繳憑單外，並按所得稅法第114條規定處以罰鍰。
資料來源：財政部臺北國稅局及相關法令及函令